阿拉尔北起天山南麓，南至塔克拉玛干沙漠北部，东临沙雅县，西抵柯坪县，傍依阿克苏河、塔里木河、台兰河、多浪河水系，东北接新和县。东西相距281公里，南北相距180公里。与吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和哈萨克斯坦接壤，与巴基斯坦和印度临近，有着较丰富的边境口岸和边贸资源。
土地革命战争时期，农一师屯垦阿拉尔以后，经广大军垦战士披荆斩棘，艰苦创业，开垦良田120万余亩，兴建了10个农牧团场，被誉为“塞外江南”，创造了人进沙退、人造绿洲的旷世奇迹。“生在井冈山、长在南泥湾、转战数万里、屯垦在天山”是农一师的光辉历程，它使阿拉尔有着丰厚的军旅和屯垦历史积淀。
二十世纪60年代初，就提出了“北有石河子，南有阿拉尔,两颗明珠交相辉映”的兵团城市建设的战略构想，后因多种历史原因未能如愿。
阿拉尔市属塔里木河冲积细土平原，沿河岸及冲沟两侧略有抬升，地势由西北向东南倾斜。水资源有阿克苏河、塔里木河及胜利、上游、多浪三大平原水库。
阿拉尔市属于暖温带极端大陆性干旱荒漠气候，极端最高气温35℃（沙井子垦区每隔5～10年遇最高温40℃），极端最低气温-28℃（四团垦区最低气温为-33.2℃）。垦区太阳辐射年均133.7～146.3千卡/平方厘米。年均日照2556.3～2991.8小时，日照率为5869%。垦区雨量稀少，冬季少雪，地表蒸发强烈，年均降水量为40.1～82.5毫米，年均蒸发量1876.6～2558.9毫米。
阿拉尔市农业以灌溉为主，主要利用昆马力克河、哈拉玉尔滚河、阿克苏河、多浪河、叶尔羌河以及和田河等河水。
阿拉尔市辖幸福路街道、金银川路街道、青松路街道、南口街道、托喀依乡、一团金银川镇、二团新井子镇、三团甘泉镇、四团永宁镇、五团沙河镇、六团双城镇、七团、八团、九团、十团、十一团花桥镇、十二团、十三团幸福镇、十四团金杨镇、十五团、十六团。
