中医没有手足口病的病名，临床选用中成药时，根据患儿临床证型，表现的不同而选用不同的药物即可。
邪犯肺脾证
主要临床表现：发热轻微，或无发热，或流涕咳嗽，口腔、手掌、足趾部疱疹，分布稀疏，疹色红润，疱液清亮。
常用中成药：疏风解毒胶囊、蒲地蓝口服液，双黄连口服液、蓝芩口服液、小儿热速清口服液、小儿豉翘清热颗粒、清热解毒口服液等。
用药指导：该证型属于手足口病初起，上述药物均可选用，双黄连口服液、蓝芩口服液、蒲地蓝口服液用于初起轻度发热，咽痛明显者，小儿热速清口服液和小儿豉翘清热颗粒用于发热，咽痛者，尤其对于手足口病初起、大便干结者可优先选用，清热解毒口服液用于病初即发热较高 的患儿。
心脾积热证
主要临床表现：心烦躁扰，口干舌燥、疼痛把拒食，小便黄赤，大便干结，手掌，足趾，口腔疱疹，分布稀疏，疹色红润，疱液清亮。
常用中成药：健儿清解液、小儿化毒散，导赤丸等。
用药指导：该证为手足口病轻症，但口疱疹较甚，进食较困难，大便干结。健儿清解液主要用于手足口病口部疱疹较甚、进食较困难的患儿，小儿化毒散主要用于手足口病口咽部症状明显的患儿。导赤丸用于手足口病热盛、大便干结的患儿。
湿热蒸盛证
主要临床表现：高热，口臭，大便干结，手、足、口部及四肢、臀部疱疹，全身症状明显。
常用中成药：清胃黄连丸、黄桅花口服液，清开灵口服液等。
用药指导：该证多见于手足口病重症，年幼儿及感邪较重者。清胃黄连丸主要用于手足口病高热，口臭的患儿，黄栀花口服液用于大便干结者，其内含大黄，素体脾胃虚寒、脾胃虚弱及大便次数多者慎用，清开灵口服液用于手足口病较重，手、足、口部及四肢，臀部疱疹，全身症状明显的患儿。
